当服务器遭受攻击时，能否正常运行取决于攻击的程度和采取的应对措施。下面将介绍几种常见的应对方法。

首先，在得知系统正在遭受攻击后，应立即切断网络以保护服务器网络内的其他主机。接着，通过日志分析找出可疑信息，并查看系统打开了哪些端口、运行了哪些进程，以确定攻击源。

其次，分析入侵原因和途径。攻击可能源于系统漏洞或程序漏洞，因此要查清原因并找到攻击途径，以便进行漏洞的修复。

另外，可以采取以下措施预防服务器遭受攻击：

定期扫描漏洞，特别是对于骨干节点的计算机，加强主机安全非常重要。

在骨干节点配置防火墙，以抵御DDoS攻击和其他一些攻击。在受到攻击时，可以将攻击导向一些不重要的或天生防范攻击优秀的系统。

用足够的机器承受黑客攻击。这是一种较为理想的应对策略。如果用户拥有足够的容量和资源，黑客攻击会在不断访问用户、夺取用户资源的过程中逐渐消耗能量，最终无法继续攻击。

过滤不必要的服务和端口。只开放必要的服务端口，例如WWW服务器只开放80端口，而在防火墙上做阻止策略。

检查访问者的来源。可以使用UnicastReversePathForwarding等方法检查访问者的IP地址是否真实，以防止黑客采用假IP地址方式迷惑用户。

过滤所有RFC1918IP地址。RFC1918IP地址是内部网的IP地址，应该将其过滤掉。

限制SYN/ICMP流量。在路由器上配置SYN/ICMP的最大流量来限制SYN/ICMP封包所能占有的最高频宽，以防止异常流量。

最后，如果服务器遭受攻击，可以根据服务器业务情况分类处理。例如，在线服务不能立即采用任何影响业务的手段，需要根据相应流程进行处理。

总之，服务器遭受攻击后能否正常运行取决于攻击程度和采取的应对措施。采取预防措施和应对措施可以降低服务器被攻击的可能性和影响。